El centro educativo fue impulsado por la colaboración de los habitantes de San Juanillo. Sus instalaciones se reconstruyeron con apoyo del Gobierno y actualmente dispone de cinco aulas, comedor escolar, servicios sanitarios y bodega.

Atiende Educación Preescolar y I y II Ciclos de la Educación General Básica. Cuenta con docentes de primaria, preescolar y materias complementarias, profesionales de Educación Especial y personal administrativo y de servicios.

La comunidad se encuentra aproximadamente a 53,7 kilómetros al sur de Santa Cruz. Su historia está vinculada a la antigua hacienda San Juanillo, de Federico Sobrado. Desde 1950 se establecieron familias que, ante la falta de caminos, se trasladaban a caballo. Entre sus primeros pobladores figuran Remberto Torres, Higinio Vargas Piedras, Leonardo Soto, Eloísa Guevara Pizarro y Luis Muñoz.

El 14 de diciembre de 1985 se entregaron cien títulos de propiedad mediante la intervención del Instituto de Desarrollo Agrario, lo que ayudó a consolidar la comunidad. Hoy, la pesca, el turismo y la riqueza natural de Playa San Juanillo forman parte de su identidad.

La ASADA, la Asociación de Desarrollo Integral, la Asociación de Pescadores y otras organizaciones comunales contribuyen al bienestar local. La escuela mantiene una relación cercana con las familias y estas organizaciones para ofrecer una educación inclusiva y oportunidades para la niñez.